بخش عمده مشکلات گوشی های Pixel و Pixel XL مربوط به نقص های نرم افزاری است که از قفل کردن ناگهانی و بدون دلیل تا تاخیر و کندی در اجرای برنامه ها را شامل می شود.
یکی از کاربران گوشی پیکسل ایکس ال 128 گیگابایتی از اینکه برخی اوقات این گوشی بدون دلیل قفل کرده و برنامه های مختلف را اجرا نمی کند اظهار نارضایتی کرده و افزوده که تنها راه چاره برای وی صبر کردن برای چند دقیقه بوده تا گوشی از حالت قفل خارج شود.
در برخی موارد مشابه هم کاربران گفته اند مجبور به راه اندازی مجدد گوشی پیکسل بوده اند تا بتوانند فعالیت های مورد نظرشان را انجام دهند.
تعدادی از کاربران می گویند با پاک کردن برخی برنامه ها موفق به حل این مشکل شده اند، اما عده ای دیگر می گویند کاستن از برنامه های نصب شده نیز مشکل آنها را برطرف نکرده است.
گوگل چندی قبل وعده داد با به روزرسانی نرم افزاری گوشی های تولیدی خود تلاش خواهد کرد این مشکل را تاحد امکان برطرف کند.